生命健康
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一种bulk转录组细胞类型反卷积的集成分析系统

项目(成果)单位:

中国科学院合肥物质科学研究院


项目简介:

该分析系统输入单细胞测序或纯化细胞表达谱数据后,可以自动化构建签名矩阵,对输入的bulk表达谱数据进行高分辨率的细胞类型反卷积,得到不同实验和对照条件的细胞含量及其表达值差异,实现了人工构建签名矩阵及结果的自动化评价,减轻了繁琐的人工过程,同时能够推断受体和配体介导的细胞通讯并输出其结果。可以应用到人、小鼠的各种正常组织和肿瘤组织高分辨率细胞类型反卷积。